精子稀少的原因有多种。一般来说，精索静脉曲张是常见原因之一，它会使睾丸局部温度升高，影响睾丸的生精功能，据统计，约有39%的男性不育是由精索静脉曲张引起的，其中部分就与精子稀少相关。
内分泌因素：
垂体功能减退： 垂体分泌的促性腺激素等异常，会影响睾丸的生精功能。比如垂体瘤患者，垂体瘤可能会压迫垂体，导致促性腺激素分泌减少，进而影响精子的生成。甲状腺功能异常： 甲状腺功能亢进或减退都会干扰内分泌平衡，影响精子的产生。甲状腺功能亢进时，身体代谢紊乱，可能抑制精子的生成；甲状腺功能减退时，也会影响激素的正常调节，导致精子稀少。
生殖系统感染：
附睾炎： 附睾是储存和输送精子的重要器官，附睾炎会影响精子的质量和数量。例如，大肠杆菌等细菌感染引起的附睾炎，会破坏附睾内的微环境，阻碍精子的正常生成和发育。前列腺炎： 前列腺分泌的前列腺液是精液的重要组成部分，当前列腺发生炎症时，会影响精液的成分和理化性质，从而影响精子的生存和活动，导致精子稀少。
生活习惯因素：
长期吸烟酗酒： 烟草中的尼古丁等有害物质会影响精子的生成和活力，长期大量吸烟的男性，精子数量往往比不吸烟的男性少。酒精也会对睾丸的生精功能产生抑制作用，长期酗酒的男性，精子稀少的发生率会增高。高温环境影响： 长期处于高温环境中，比如经常洗热水澡、穿紧身裤等，会使睾丸局部温度升高，影响精子的生成。因为精子生成需要相对较低的温度，高温会干扰生精上皮的正常功能。