总是口腔溃疡可能由多种原因引起，比如复发性阿弗他溃疡，其患病率约为20%左右。
一、局部因素导致
创伤性因素：口腔内有残根、残冠或者不合适的假牙等，会持续刺激口腔黏膜，从而引发口腔溃疡。比如长期存在的锐利牙尖，可能几个月甚至更长时间都会刺激对应部位黏膜，导致溃疡反复出现。感染因素： 病毒感染是常见原因之一，像单纯疱疹病毒感染，当人体抵抗力下降时，病毒就会活跃起来，引发口腔溃疡。一般初次感染后，病毒会潜伏在体内，当遇到诱因时就会复发。
二、全身因素导致
免疫系统异常：自身免疫性疾病患者，如白塞病患者，免疫系统会错误地攻击自身组织，容易反复出现口腔溃疡。这类患者除了口腔溃疡，还可能有眼部、生殖器等部位的病变。营养缺乏：缺乏维生素B12、铁、锌等营养素时，也容易出现口腔溃疡。比如长期素食者，如果不注意补充维生素B12，就可能因缺乏而引发口腔溃疡，一般这种情况通过补充相应营养素后，溃疡情况会有所改善，但可能需要几周时间。内分泌变化：女性在月经周期前后，体内激素水平变化较大，容易出现口腔溃疡。比如有些女性在月经前1 - 2周开始出现口腔溃疡，月经来潮后逐渐减轻。
三、其他因素导致
精神因素：长期精神紧张、焦虑、压力大等，会影响人体的免疫系统和内分泌等，从而增加口腔溃疡的发生风险。比如考试期间的学生，由于精神高度紧张，口腔溃疡的发生率会明显升高。遗传因素：如果家族中有多人容易患口腔溃疡，那么遗传因素可能起到一定作用。研究发现，有口腔溃疡家族史的人，其发病几率比没有家族史的人要高2 - 3倍。