拔牙后会将牙根一并拔除，而拔牙后拔牙位置疼痛的原因主要有：一是拔牙后反应性疼痛，二是拔牙后感染，三是干槽症引起的疼痛，并非是牙根疼痛。应及时到医院口腔科进行检查以确定治疗方案。
一、反应性疼痛：牙齿拔除后通常患者都会有轻微疼痛，这种症状一般可自行缓解，无需特殊处理。但若是拔牙后创伤较大，比如下颌智齿拔除后，常常会出现较为严重的疼痛。此时，必要时可遵医嘱使用药物来改善症状，如布洛芬缓释胶囊或洛索洛芬钠片等。
二、感染：拔牙后的急性感染多发生在下颌智齿拔除后，特别是在急性炎症期进行拔牙且处理不当时，容易引发颌面部间隙感染，主要会导致咽峡前间隙感染。这时应当沿舌神经走行方向切开黏膜，并引流脓液，同时遵医嘱使用奥硝唑片、头孢克肟颗粒、洛索洛芬钠片等药物进行治疗。
三、干槽症：主要在拔牙后不久发生。患者会感到疼痛剧烈，并可向耳颞部、下颌区或头顶部放射，一般的镇痛药物往往不能起到镇痛效果。临床检查会发现拔牙窝内空虚或有腐败性的血凝块，腐臭味强烈。需要通过彻底清创以及隔离外界对牙槽骨的刺激，从而达到迅速止痛、缓解疼痛的目的。
总之，拔牙后出现疼痛要根据具体情况判断原因并采取相应的治疗措施。