指甲不平有凹凸可能由多种原因造成。比如，甲癣是常见原因之一，甲癣是由皮肤癣菌等真菌感染引起的，约有30%的皮肤癣菌感染会累及指甲。
一、营养缺乏因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素A、B族维生素、维生素C、维生素E等时，可能影响指甲的正常生长，导致指甲不平有凹凸。例如，缺乏维生素A时，指甲可能会变得粗糙、凹凸不平。一般来说，正常成年人每天需要摄入一定量的维生素，如维生素A，男性约为800微克视黄醇当量，女性约为700微克视黄醇当量。微量元素缺乏： 缺乏铁、锌等微量元素也可能引发指甲问题。缺铁会影响血红蛋白的合成，导致指甲供氧不足，从而出现凹凸不平的情况；锌参与身体多种代谢过程，缺锌时指甲可能出现异常。成年男性每天锌的推荐摄入量约为15.5毫克，成年女性约为11.5毫克。
二、疾病因素
甲母质病变： 甲母质是指甲生长的起点，如果甲母质发生病变，如甲母质痣等，可能会影响指甲的正常生长，导致指甲出现凹凸不平的改变。甲母质痣有一定的恶变风险，但恶变概率相对较低。全身性疾病： 一些全身性疾病也可能反映在指甲上，比如银屑病患者约有50%会出现指甲病变，表现为指甲凹凸不平、点状凹陷等；慢性湿疹也可能累及指甲，导致指甲形态改变。
三、外部因素
外伤： 手指受到外伤，如砸伤、挤压伤等，如果损伤到甲床或甲母质，就可能影响指甲的生长，导致指甲长出后不平有凹凸。比如手指被重物砸到后，新长出来的指甲可能会出现不平整的情况。长期接触刺激性物质： 经常接触洗涤剂、消毒剂、有机溶剂等刺激性化学物质，会损伤指甲的角质层，影响指甲的正常状态，导致指甲凹凸不平。例如，经常做家务频繁接触洗洁精等洗涤剂的人，指甲更容易出现问题。