嘴呼吸和鼻呼吸有诸多区别。首先，从空气过滤角度看，鼻呼吸时，鼻腔内的鼻毛能阻挡空气中的灰尘、颗粒物等，据研究，鼻腔可过滤掉空气中约50%的较大颗粒杂质，而嘴呼吸时，空气没有鼻腔的过滤，更多杂质易直接进入呼吸道；
呼吸时的空气过滤情况
鼻呼吸： 鼻腔内的鼻毛能有效阻挡空气中较大的灰尘、颗粒物等，像直径大于5微米的颗粒，约50%可被鼻腔过滤。嘴呼吸： 空气直接通过口腔进入，没有鼻毛阻挡，更多杂质易直接进入呼吸道。其次，在湿度调节方面，鼻黏膜能分泌黏液，对吸入的空气进行加湿，一般能将空气湿度调节到60% - 80%适宜范围，而嘴呼吸时，空气未经鼻腔加湿，容易使口腔和咽喉干燥；
湿度调节情况
鼻呼吸： 鼻黏膜分泌黏液，可将吸入空气湿度调节至60% - 80%的适宜范围。嘴呼吸： 空气未经鼻腔加湿，易致口腔和咽喉干燥。再者，从对免疫系统的影响来讲，鼻呼吸时，鼻腔中的一些免疫物质能参与呼吸道的免疫防御，有助于维持呼吸道的健康，而长期嘴呼吸可能会影响呼吸道的免疫功能；
对免疫系统的影响
鼻呼吸： 鼻腔中的免疫物质参与呼吸道免疫防御，利于维持呼吸道健康。嘴呼吸： 长期嘴呼吸可能影响呼吸道免疫功能。另外，在睡眠方面，长期用嘴呼吸可能会导致睡眠质量下降，出现打鼾等问题，还可能影响面部发育，尤其对儿童来说，长期嘴呼吸可能造成上颌骨变长、牙齿排列不整齐等情况；而鼻呼吸有助于保证睡眠时呼吸的顺畅和正常面部发育。
睡眠及面部发育影响
嘴呼吸： 长期嘴呼吸易致睡眠质量下降，出现打鼾，还可能影响儿童面部发育，使上颌骨变长、牙齿排列不整等。鼻呼吸： 有助于保证睡眠时呼吸顺畅，利于儿童正常面部发育。