扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是低危型的HPV - 3型、HPV - 5型等。一般来说，当人体皮肤有破损时，HPV就容易侵入并感染上皮细胞，从而导致扁平疣的形成。
病毒传播途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者直接握手等接触，就有可能被传染。如果健康人的皮肤有细微破损，接触到患者皮损部位的病毒，就有感染风险。间接接触传播： 通过接触被患者污染的物品，像共用毛巾、衣物等，也可能感染HPV，进而引发扁平疣。
易患人群特点
免疫力低下者： 当人体免疫力较低时，比如长期熬夜、过度劳累、患有某些慢性疾病等情况，身体对HPV的抵御能力下降，就更容易感染HPV从而患上扁平疣。例如，长期熬夜的人，免疫力会受到影响，相比作息规律的人更易感染。青少年和儿童： 青少年和儿童的免疫系统还在发育中，相对比较脆弱，所以也是扁平疣的高发人群。他们在学校、集体生活环境中，如果接触到病毒，感染几率相对较高。
皮肤屏障受损因素
皮肤外伤： 皮肤受到外伤，如抓伤、擦伤等，会使皮肤的屏障功能受损，这时候HPV就更容易侵入。比如孩子在玩耍时不小心擦伤了皮肤，若接触到HPV病毒，就可能患上扁平疣。皮肤过度摩擦： 一些部位长期受到摩擦，像手部经常干活、摩擦的人，皮肤屏障容易被破坏，也增加了感染HPV引发扁平疣的可能性。比如从事手工劳动的人，手部皮肤容易因摩擦受损而感染病毒。