更年期女性缺钙时，常见的症状有骨骼方面的表现，比如约50%以上的更年期女性会出现腰背疼痛，疼痛可沿脊柱向两侧扩散，仰卧或坐位时疼痛减轻，直立时后伸或久立、久坐时疼痛加剧，日间疼痛轻，夜间和清晨醒来时加重。
骨骼肌肉方面的表现
骨质疏松相关表现：更年期女性缺钙容易引发骨质疏松，这会使骨骼变得脆弱，更容易发生骨折。比如轻微的碰撞或跌倒就可能导致手腕、髋部等部位骨折。另外，还会出现身高变矮的情况，随着年龄增长和缺钙加重，脊椎骨可能会发生压缩性骨折，导致身高逐渐变矮。肌肉痉挛：常常会出现腿部肌肉痉挛，也就是俗称的“腿抽筋”。夜间更容易发生，严重时会影响睡眠。例如，在睡眠中可能会被腿部突然的痉挛痛醒。
神经系统相关表现
感觉异常：部分更年期女性会有手足麻木的感觉，尤其是手指部位比较明显。还可能出现皮肤蚁走感，就像有蚂蚁在皮肤上爬一样的感觉。神经兴奋性增高：会表现出情绪不稳定，容易烦躁、焦虑。因为缺钙会影响神经肌肉的兴奋性，导致神经功能紊乱，从而影响情绪状态。
其他系统相关表现
牙齿问题：缺钙会使牙齿的坚固性下降，容易出现牙齿松动的情况。而且更年期女性本身口腔健康就可能因为激素变化等因素受到影响，再加上缺钙，牙齿问题会更明显。心血管系统影响：虽然相对少见，但严重缺钙时可能会影响心血管系统，导致心律不齐等情况。不过这种情况比较罕见，一般是在严重缺钙且长期未得到纠正时才会出现。