结核性腹膜炎治疗主要依靠抗结核药物，常用的有异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等，一般需要规范治疗6-9个月左右。
药物治疗方案
一线抗结核药：异烟肼是常用药物，能抑制结核菌DNA合成，发挥杀菌作用。利福平可阻碍结核菌RNA合成，达到杀菌效果。吡嗪酰胺能杀灭细胞内、酸性环境中的结核菌。乙胺丁醇可抑制结核菌RNA合成，起到抑菌作用。联合用药原则：通常采用多种药物联合治疗，比如异烟肼联合利福平联合吡嗪酰胺联合乙胺丁醇，这样能提高疗效，还能减少耐药菌产生。
手术治疗情况
手术指征：当出现完全或不全肠梗阻，经内科治疗无效时；急性肠穿孔，或腹腔脓肿经抗生素治疗无效时；肠瘘经抗结核化疗与加强营养而未能闭合者，可能需要手术治疗。一般约10%的患者可能需要手术干预。术后注意：手术后仍需继续抗结核治疗，一般疗程不少于6个月。
其他治疗方式
营养支持：患者需要加强营养，尤其是蛋白质、维生素等的补充，一般每日蛋白质摄入量可保证在100g左右，热量摄入要足够，以维持机体正常代谢，促进病情恢复。对于有腹水的患者，可能还需要限制钠的摄入，每日钠摄入控制在500-800mg。腹腔穿刺放腹水：如果腹腔积液量较多，引起明显腹胀等症状时，可进行腹腔穿刺放腹水，一次放腹水一般不超过3000ml，放腹水后要密切观察患者情况，防止出现低血压等不良反应。