药流后孕囊没有排出来，应及时就医，医生一般会根据具体情况采取以下措施。
1.进行B超检查：B超可以帮助医生了解孕囊的位置、大小和形态，以及子宫内的情况。如果孕囊较小且位置靠近子宫口，可以通过清宫术将其取出。
2.药物治疗：如果孕囊较小且位置较深，可以先尝试使用药物促进子宫收缩，帮助孕囊排出。常用的药物有米非司酮和米索前列醇等。
3.再次药流：如果第一次药流失败，可以在医生的指导下进行再次药流。但需要注意，再次药流的成功率也不是100%，而且可能会对身体造成更大的伤害。
4.手术治疗：如果孕囊较大或药流失败，可能需要进行手术治疗，如刮宫术、宫腔镜下取胚术等。
需要注意的是，药流后孕囊没有排出来可能会导致宫腔感染、大出血等并发症，严重时甚至会危及生命。因此，如果药流后出现阴道流血过多、腹痛等异常情况，应及时就医。此外，药流后要注意休息，避免劳累和剧烈运动，同时要注意个人卫生，保持外阴清洁。
此外，在进行药流前，应该进行全面的身体检查，确保身体状况适合药流。药流后，要按照医生的建议进行复查，以确保药流成功。如果对药流有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通。