扁桃体炎的治疗药物需根据病情来选择，一般细菌感染引起的扁桃体炎常用抗生素，比如青霉素类抗生素，像阿莫西林等，若是对青霉素过敏，可选用头孢类抗生素等。一般来说，经过规范用药，多数患者能在数天内症状有所缓解。
细菌感染引发扁桃体炎的用药
青霉素类药物： 阿莫西林是比较常用的青霉素类抗生素，它对大多数引起扁桃体炎的链球菌等有较好的抗菌作用。不过使用前需要确认患者没有青霉素过敏史。头孢类药物： 如果对青霉素过敏，可以考虑头孢拉定等头孢类抗生素。头孢类抗生素同样是通过抑制细菌细胞壁的合成来发挥抗菌作用，对扁桃体炎常见致病菌有效。
病毒感染引发扁桃体炎的用药
抗病毒药物： 若为病毒感染导致的扁桃体炎，一般不需要使用抗生素。比如由腺病毒引起的扁桃体炎，目前没有特效的抗病毒药物，主要是对症治疗，但有些情况下可能会用到干扰素等，不过干扰素的使用需要在医生严格评估下进行。
对症治疗的药物
解热镇痛药： 当扁桃体炎患者有发热、咽痛较明显的情况时，可以使用解热镇痛药，像对乙酰氨基酚。它能起到退热、缓解疼痛的作用，儿童可以使用儿童剂型的对乙酰氨基酚。不过要注意按照儿童的体重等正确使用剂量，避免过量。含漱液： 局部使用含漱液也能缓解症状，比如复方硼砂含漱液，它可以清洁口腔、杀菌，减轻扁桃体炎引起的咽部不适等症状。使用时按照说明书要求稀释后含漱。
特殊人群用药注意
儿童患者： 儿童扁桃体炎用药需要格外谨慎，比如抗生素的选择和剂量都要根据儿童的体重、年龄等准确计算。像小于3个月的婴儿患扁桃体炎，用药更要严格遵医嘱，因为婴儿肝肾功能发育不完善，药物代谢能力差。孕妇患者： 孕妇患扁桃体炎用药需特别小心，很多药物可能会对胎儿产生影响。如果是细菌感染，选择抗生素时要选对胎儿影响小的药物，必须在医生指导下权衡利弊后用药。