肾输尿管结石的主要症状包括疼痛、血尿等。其中，肾输尿管结石引发的疼痛较为典型，约有一半患者会出现肾绞痛，通常是突然发作，疼痛剧烈，如刀割般，常位于腰腹部，可放射至下腹部、腹股沟及会阴部等部位，疼痛可持续数分钟至数小时不等。
一、疼痛表现
肾区隐痛或钝痛： 部分患者会感觉肾区有隐隐的胀痛或钝痛，这种疼痛可能会持续存在，在活动后可能会加重。比如一些患者在长时间行走或剧烈运动后，肾区的隐痛会更加明显。肾绞痛： 如前面所说，肾绞痛是比较典型的症状，多由结石在输尿管内移动，引起输尿管痉挛所致。疼痛来势汹汹，患者往往难以忍受，同时可能伴有恶心、呕吐等症状。
二、血尿情况
肉眼血尿： 有些患者可以看到尿液颜色发红，呈现肉眼血尿的情况。这是因为结石在移动过程中，会损伤肾盂、输尿管的黏膜，导致毛细血管破裂出血，血液混入尿液中就会使尿液变红。一般来说，肉眼血尿在活动后可能会更加明显。镜下血尿： 还有不少患者没有明显的肉眼血尿表现，但通过显微镜检查尿液时，可以发现有红细胞存在，即镜下血尿。这部分患者往往容易被忽视，但也是肾输尿管结石的常见症状之一。
三、其他伴随症状
排尿异常： 结石如果堵塞输尿管，可能会影响尿液的排出，导致患者出现排尿困难、尿频、尿急等症状。例如，结石较大堵塞输尿管时，尿液排出不畅，膀胱内尿液不能完全排空，就会频繁产生尿意，出现尿频、尿急，同时排尿时可能感觉费力。感染相关症状： 如果结石引起尿路梗阻，导致尿液引流不畅，容易继发感染，此时患者可能会出现发热、寒战等全身感染症状，同时尿液可能会变得混浊，伴有异味等。