子宫纵隔主要是胚胎发育过程中，双侧副中肾管融合受阻所致。
先天发育因素
在胚胎时期，双侧副中肾管融合的过程出现异常，就可能导致子宫纵隔的形成。这是一种先天性的结构异常情况，由胚胎发育阶段的基因等因素影响双侧副中肾管的正常融合过程引发。
遗传因素影响
部分研究表明，遗传因素可能在子宫纵隔的发生中起到一定作用。如果家族中有相关的遗传倾向，那么个体发生子宫纵隔的概率可能会相对增高。但具体的遗传机制还在进一步的研究探索中。
孕期不良因素影响（潜在相关）
孕期母亲接触某些不良因素，虽然不是直接导致子宫纵隔的绝对因素，但可能会对胚胎发育产生干扰，在一定程度上可能增加子宫纵隔发生的风险。不过这种影响相对较为复杂，还需要更多研究来明确具体关联。子宫纵隔可能会对女性的生育等方面产生影响，若发现相关情况，应及时就医，在医生的指导下进行进一步的评估和处理。