自身免疫性甲状腺炎包括桥本甲状腺炎等类型，治疗需根据不同情况来。一般来说，若甲状腺功能正常，通常不需要特殊药物治疗，但要定期监测甲状腺功能，大约每6-12个月检查一次甲状腺功能和甲状腺超声。
甲状腺功能减退时的治疗
左甲状腺素钠治疗：当自身免疫性甲状腺炎导致甲状腺功能减退时，常用左甲状腺素钠片来补充甲状腺激素。一般需要根据患者的年龄、体重等调整剂量，起始剂量通常从小剂量开始，比如对于成年患者初始剂量可能在25-50微克/天左右，然后根据甲状腺功能监测结果逐渐调整。特殊人群注意：老年人使用左甲状腺素钠时要更谨慎，起始剂量宜小，因为老年人对甲状腺激素的敏感性可能改变，起始剂量一般从12.5-25微克/天开始，并且要密切监测心脏功能等指标，因为甲状腺激素可能影响心脏功能。
甲状腺肿大明显时的处理
观察随访为主：如果自身免疫性甲状腺炎患者甲状腺肿大不伴有压迫症状等，主要是定期观察随访，每3-6个月复查甲状腺超声，观察甲状腺肿大情况有无变化。药物辅助缩小肿大：有时候可能会使用一些中药辅助改善甲状腺肿大情况，但目前循证医学证据相对有限。不过一些具有调节免疫等作用的中药可能在一定程度上有帮助，但需要在医生指导下使用，且不能替代正规的甲状腺功能监测。
合并其他自身免疫性疾病时的处理
协同治疗其他疾病：如果自身免疫性甲状腺炎患者同时合并其他自身免疫性疾病，比如类风湿关节炎等，需要针对其他疾病进行相应治疗。例如合并类风湿关节炎时，如果需要使用免疫抑制剂等药物，要考虑对甲状腺功能的影响，因为一些免疫抑制剂可能对甲状腺功能有干扰，所以在用药过程中要密切监测甲状腺功能，根据情况调整自身免疫性甲状腺炎相关的治疗方案。个体化评估治疗：这种情况下治疗方案需要个体化，要综合考虑多种自身免疫性疾病的病情严重程度等因素来制定合适的治疗计划，确保在治疗其他疾病的同时，尽量减少对甲状腺功能的不良影响，并且要定期全面评估患者的整体健康状况。