优质胚胎不着床可能与多种因素有关，据相关研究，其发生率约为30% - 40%。
子宫因素方面
子宫内膜容受性不佳：子宫内膜就像胚胎着床的“土壤”，如果子宫内膜厚度不合适，比如厚度低于7mm，或者内膜存在炎症、息肉等病变，都会影响胚胎着床。例如子宫内膜炎会改变内膜的微环境，阻碍胚胎着床。子宫形态异常：像子宫纵隔、单角子宫等子宫形态异常的情况，会干扰胚胎的着床位置和着床过程。比如子宫纵隔会占据宫腔空间，影响胚胎正常着床。
胚胎自身因素方面
胚胎染色体异常：约有50% - 60%的优质胚胎不着床是因为胚胎自身染色体异常。染色体是遗传物质的载体，染色体数目或结构异常会使胚胎无法正常发育和着床。比如常见的21 - 三体综合征等染色体数目异常的胚胎，很难成功着床。胚胎质量问题：除了染色体异常，胚胎的发育潜能、细胞碎片率等也会影响着床。如果胚胎细胞碎片率超过50%，那么着床的概率就会大大降低。
免疫因素方面
自身免疫异常：体内存在抗磷脂抗体等自身抗体时，会影响胎盘的血液循环，阻碍胚胎着床。例如抗磷脂抗体阳性的女性，其体内的抗体可结合胎盘滋养细胞，导致胎盘血管血栓形成，影响胚胎营养供应，进而导致不着床。同种免疫异常：母体对胚胎的免疫排斥反应过强也会导致不着床。母体免疫系统将胚胎识别为“外来物”，启动免疫攻击，使得胚胎无法在子宫内着床生长。