骨髓炎主要是由细菌等病原体感染引起的。一般来说，细菌可通过血液传播、伤口直接感染等途径侵袭骨组织从而引发骨髓炎。比如，当人体免疫力较低时，原本存在于体内的细菌可能会通过血液循环到达骨骼部位，在那里定植繁殖，引发感染。
细菌感染途径一：血源性感染
血液传播引发： 当身体其他部位有感染病灶时，比如皮肤疖肿、扁桃体炎等，细菌可进入血液循环。儿童的骨骺板是细菌容易停留的部位，因为儿童处于生长发育阶段，骨骺板附近的血管丰富且血流缓慢，细菌就容易在此处定植，进而引发骨髓炎。例如，金黄色葡萄球菌就常通过这种血源性途径导致骨髓炎。感染灶扩散： 临近的软组织感染也可能扩散至骨骼。像足部的甲沟炎，如果没有得到及时有效的治疗，感染可能会蔓延至骨骼，引起足部的骨髓炎。
细菌感染途径二：创伤性感染
开放性伤口感染： 当骨骼受到开放性外伤，如骨折后伤口污染严重，细菌就会直接侵入骨组织。据统计，开放性骨折患者发生骨髓炎的风险比闭合性骨折高很多。比如，严重的车祸导致腿部骨折，伤口被泥土等污染，就很容易引发骨髓炎。手术创伤感染： 骨科手术过程中，如果无菌操作不严格，或者术后伤口护理不当，细菌可能会侵入骨组织。像人工关节置换手术，术后发生骨髓炎的概率虽然较低，但一旦发生会严重影响手术效果。
细菌感染途径三：蔓延性感染
邻近病灶蔓延： 相邻的软组织感染可以蔓延至骨骼。例如，脊柱周围的脓肿如果没有得到控制，可能会蔓延至脊椎骨，引发脊椎骨髓炎。另外，糖尿病患者足部的真菌感染，可能会逐渐蔓延至骨骼，导致糖尿病足合并骨髓炎。