骨髓炎主要是由细菌等病原体感染引起的。通常来说，大约50%以上的急性骨髓炎是由金黄色葡萄球菌感染导致的。
创伤性感染引发
开放性骨折后感染：当发生开放性骨折时，比如骨折断端穿透皮肤，外界的细菌就很容易进入伤口引发感染。例如，车祸导致的开放性胫骨骨折，伤口直接与外界相通，细菌很容易定植在骨折部位，从而引发骨髓炎。手术后感染：一些骨科手术，像人工关节置换术等，术后也有可能发生感染。手术过程中如果消毒不彻底，或者患者术后身体抵抗力下降，就容易让细菌侵入，导致骨髓炎。比如人工髋关节置换术后，有1%~2%的概率会发生感染引发骨髓炎。
血源性感染导致
儿童常见血源性骨髓炎：在儿童时期，血源性骨髓炎比较常见。这是因为儿童的骨骺端有丰富的毛细血管网，血流缓慢，细菌容易在此处停留繁殖。比如金黄色葡萄球菌从身体其他部位的感染病灶，通过血液循环到达儿童的长骨骨骺端，从而引发骨髓炎。成年人血源性感染情况：成年人血源性骨髓炎相对少见，但也有可能发生。比如患有糖尿病的成年人，身体抵抗力较低，血糖控制不佳时，细菌容易通过血液传播到骨骼引发骨髓炎。
慢性感染迁延
急性骨髓炎治疗不彻底：如果急性骨髓炎没有得到彻底有效的治疗，就可能转为慢性骨髓炎。例如，急性骨髓炎经过抗生素治疗后，症状暂时缓解，但细菌没有被完全清除，就会在骨骼内持续存在，慢慢发展为慢性骨髓炎，而且会反复出现疼痛、流脓等症状。局部有异物存在：如果骨骼内有内固定物等异物，也容易导致感染迁延不愈引发骨髓炎。比如骨折后植入的钢板，可能会成为细菌滋生的场所，即使经过治疗，也容易因为异物的存在而使骨髓炎反复发作。