骨髓炎主要是由细菌感染引起的，其中金黄色葡萄球菌是最常见的致病菌。大约50%以上的急性骨髓炎是由金黄色葡萄球菌导致的。
创伤性因素导致
开放性骨折引发： 当发生开放性骨折时，外界的细菌很容易直接进入骨骼内部。比如，严重的车祸导致的骨折，骨头暴露在外面，细菌就有机会侵入，从而引发骨髓炎。一般来说，开放性骨折后24 - 48小时内，如果细菌感染没有得到有效控制，就比较容易发展为骨髓炎。医源性创伤： 一些医疗操作也可能导致骨髓炎。例如，骨科手术过程中，如果手术室的消毒不严格，或者手术器械消毒不彻底，细菌就可能在手术过程中进入骨骼。像髋关节置换手术这样的大型骨科手术，虽然概率较低，但仍有发生骨髓炎的风险。
血源性感染导致
儿童高发情况： 在儿童中，血源性骨髓炎较为常见。儿童的骨骺板附近的微小终末动脉与毛细血管往往弯曲成为血管襻，血流缓慢，细菌容易在此处停留。比如，儿童感冒发烧后，细菌可能通过血液循环到达骨骼。金黄色葡萄球菌等细菌随着血液流动，到达骨骼的特定部位，就可能引发骨髓炎。免疫力低下人群： 对于免疫力低下的成年人，如糖尿病患者、艾滋病患者等，身体抵抗细菌的能力较弱。细菌容易通过血液循环到达骨骼，从而引发骨髓炎。糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的抗感染能力下降，一旦有细菌侵入血液，就更易在骨骼部位定植引发感染。
邻近组织感染蔓延导致
软组织感染波及： 邻近骨骼的软组织感染如果没有及时得到控制，细菌可能会蔓延至骨骼。例如，足部的脓性指头炎，如果病情加重，细菌可能沿着组织间隙向周围骨骼蔓延，引发骨髓炎。尤其是足部皮肤有破损，又合并感染时，这种风险会增加。骨周围感染扩散： 骨骼周围的器官感染也可能蔓延至骨骼。比如，腰椎间盘感染，如果炎症没有得到有效控制，可能会扩散到附近的骨骼，引发脊柱骨髓炎。这种情况在一些免疫系统较弱或者基础疾病较多的患者中更易发生。