总是口腔溃疡可能由多种原因引起。一般来说，复发性阿弗他溃疡在人群中的患病率约为20%左右。
局部因素导致
创伤性溃疡： 如果口腔内有残根、残冠，或者佩戴不合适的假牙，长期摩擦口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡。比如有的患者牙齿有锐利的边缘，持续刺激口腔黏膜，就会反复出现溃疡。局部感染： 口腔内的细菌、病毒感染也可能导致口腔溃疡。像疱疹病毒感染引起的疱疹性口炎，就会出现成簇的小水疱，破溃后形成溃疡。
全身因素引起
缺乏营养素： 当人体缺乏维生素B族、维生素C等营养素时，容易出现口腔溃疡。例如长期偏食、挑食的人，摄入维生素不足，就比较容易反复长口腔溃疡。一般来说，维生素B2缺乏时，可能影响黏膜的正常代谢，从而引发溃疡。免疫系统异常： 自身免疫性疾病患者，如白塞病，会经常出现口腔溃疡，同时还可能伴有眼部病变、生殖器溃疡等症状。这类疾病是由于免疫系统攻击自身组织导致的。内分泌变化： 女性在月经前后，体内激素水平发生变化，也可能出现口腔溃疡。有些女性每到月经前期，口腔溃疡就容易复发，月经结束后可能会自行缓解。
生活方式相关
精神压力过大： 长期处于高压力状态下，会影响人体的免疫系统和内分泌等功能，从而增加口腔溃疡的发生几率。比如学生考试前、工作压力大的人群，容易反复长口腔溃疡。睡眠不足： 长期睡眠不足会导致身体的各项机能失调，免疫力下降，进而容易引发口腔溃疡。成年人建议每天保证7 - 8小时的充足睡眠，睡眠不足的人就更易受口腔溃疡困扰。