唇腭裂的发生与多种因素有关。据统计，唇腭裂的发生概率约为每700个新生儿中就有1例。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有唇腭裂，那么后代发生唇腭裂的风险会增加。研究发现，遗传因素在唇腭裂发病中占比较高，约有20% - 30%的唇腭裂患儿是由于遗传因素导致的。比如父母一方患有唇腭裂，其子女患病风险比正常人群要高很多。特定基因变异： 某些特定基因的变异也与唇腭裂的发生密切相关。例如，MSX1、IRF6等基因的突变可能会影响面部发育过程，增加唇腭裂发生的可能性。
孕期环境因素影响
孕妇感染： 孕妇在孕期如果感染了风疹病毒等，就可能增加胎儿患唇腭裂的风险。在怀孕早期（尤其是妊娠前3个月），如果孕妇感染风疹病毒，胎儿发生唇腭裂的概率会明显升高。因为孕期感染会干扰胚胎面部组织的正常发育。孕期药物影响： 孕妇在孕期不合理使用一些药物也可能导致胎儿唇腭裂。比如孕期服用某些抗癫痫药物等，这些药物可能通过影响胚胎的发育过程，引发面部结构发育异常，进而导致唇腭裂。孕期营养缺乏： 孕妇在孕期缺乏某些重要营养物质，如叶酸等，会影响胎儿的正常发育。叶酸对细胞的分裂和分化起着重要作用，孕期叶酸缺乏可能干扰面部组织的融合过程，增加唇腭裂发生的几率。一般建议孕妇从孕前3个月开始补充叶酸，每天补充量约0.4 - 0.8毫克。
其他环境因素相关
环境污染： 孕妇长期处于污染的环境中，如接触过多的化学毒物、空气污染等，也可能对胎儿面部发育产生不良影响。例如，长期接触工业废气、农药等，其中的有害化学物质可能干扰胚胎的正常发育，增加唇腭裂发生风险。不良生活习惯： 孕妇在孕期吸烟、酗酒等不良生活习惯也与唇腭裂的发生有关。吸烟会导致胎盘血液循环障碍，影响胎儿的营养供应；酗酒则可能直接损害胎儿的发育，增加唇腭裂等畸形发生的概率。