会厌囊肿的治疗方式需根据囊肿大小、症状等因素来定。较小且无症状的会厌囊肿，可定期观察，大约每3 - 6个月复查一次喉镜，看囊肿有无变化。而较大或有症状的会厌囊肿，多需要手术治疗。
手术治疗方式
支撑喉镜下囊肿切除术： 这是常用的手术方法。通过支撑喉镜暴露会厌囊肿，然后用激光、电刀等将囊肿切除。这种手术创伤相对较小，术后恢复较快。一般来说，患者在术后1 - 2周左右就能基本恢复正常的吞咽和发声功能。低温等离子射频消融术： 利用低温等离子技术对囊肿进行消融。它的优点是出血少、术后水肿轻。手术过程相对精准，对周围组织的损伤较小。术后患者的疼痛程度可能会比传统手术轻一些，恢复时间大概也是1 - 2周左右。
保守治疗情况
对于一些非常小且没有任何不适症状的会厌囊肿，在医生评估后可以选择保守观察。但在观察期间，需要密切关注自身症状，比如是否出现吞咽困难、呼吸困难等情况。如果在观察过程中发现囊肿有增大趋势或者出现了相关症状，就需要及时转为手术治疗。而且在保守观察期间，要避免过度用嗓，保持口腔清洁，防止感染等情况发生影响囊肿。
术后注意事项
手术后患者要注意饮食，短期内宜吃温凉、细软的食物，像米粥、软面条等，避免吃辛辣、刺激性强以及过硬的食物，防止刺激手术部位引起疼痛或出血。同时要按照医生的要求按时复诊，一般术后1周、1个月、3个月都需要复查喉镜，观察手术部位的恢复情况。如果出现发热、剧烈咽痛、呼吸困难等异常情况，要立即就医。