扁桃体炎的临床表现多样，常见的有咽痛，尤其是吞咽时疼痛明显，成年人患急性扁桃体炎时，咽痛通常较为剧烈，可能影响进食。儿童患扁桃体炎时，可能因咽痛而哭闹不安。
局部症状
咽部疼痛： 急性扁桃体炎最常见的局部症状就是咽部疼痛，开始可能是一侧咽痛，继而可发展为双侧。疼痛较为剧烈时，患者吞咽会受到明显影响。例如，有的患者会感觉吞咽口水都很困难。慢性扁桃体炎患者也会有咽部不适、异物感等症状，但疼痛相对急性的较轻。扁桃体红肿： 急性扁桃体炎时，扁桃体明显红肿，表面可能有白色或黄色的渗出物，这些渗出物有时可连成膜状，但容易拭去。慢性扁桃体炎患者的扁桃体可能会增生、肥大，表面凹凸不平，有时可见瘢痕，与周围组织粘连等情况。
全身症状
发热： 急性扁桃体炎患者常出现发热症状，体温可高达38℃~ 39℃甚至更高。儿童患急性扁桃体炎时，发热可能更为明显，有的儿童体温迅速升高，还可能伴有寒战。一般来说，急性扁桃体炎引起的发热，经过积极治疗后，体温可在3~5天内逐渐恢复正常。全身不适： 患者可能会感到全身乏力、头痛、食欲减退等。儿童全身不适的表现可能更突出，比如精神萎靡，不愿意活动等。
伴随症状
颈部淋巴结肿大： 急性扁桃体炎时，颈部淋巴结可能会肿大，尤其是下颌角处的淋巴结，有压痛感。慢性扁桃体炎患者如果病情发作，颈部淋巴结也可能出现肿大情况，但一般程度相对较轻。呼吸困难： 少数情况下，特别是儿童扁桃体过度肥大时，可能会引起呼吸困难，表现为呼吸急促，睡眠时可能出现打鼾、张口呼吸等情况。如果儿童出现呼吸困难，家长要引起重视，及时就医。