心脏神经官能症的病因目前尚未完全明确，但一般认为与多种因素有关。研究发现，大约有30% - 50%的心脏神经官能症患者可能存在神经类型的影响，比如神经类型为弱型、抑郁型或强迫型的人相对更容易患上该病。
心理社会因素
精神应激： 长期处于精神紧张、焦虑、抑郁等不良情绪状态下，比如面临工作压力过大、生活中遭遇重大变故（如亲人离世、婚姻破裂等），这些精神应激因素会对神经系统产生影响，进而干扰心脏的正常神经调节功能，增加患心脏神经官能症的风险。例如，有研究表明，经历严重生活事件后的人群，心脏神经官能症的发病率比一般人群高出2 - 3倍。性格特点： 具有敏感、多疑、情绪不稳定、内向、固执等性格特点的人也更容易罹患心脏神经官能症。这类人群往往对身体的细微变化过度关注和担忧，当出现一些轻微的身体不适时，容易放大并引发心理上的焦虑，从而影响神经 - 心脏的调节平衡。
神经生物学因素
神经递质失衡： 体内的神经递质如5 - 羟色胺、去甲肾上腺素等在情绪调节和心脏功能调节中起着重要作用。当这些神经递质出现失衡时，就可能导致心脏神经官能症的发生。比如，5 - 羟色胺水平降低可能与情绪抑郁相关，同时也会影响心脏的神经传导，进而出现心悸、胸闷等类似心脏疾病的症状，但实际上并非真正的心脏器质性病变。自主神经功能紊乱： 自主神经系统包括交感神经和副交感神经，它们共同调节心脏的跳动、血管的收缩等功能。当自主神经功能紊乱时，交感神经可能处于相对兴奋状态，导致心率加快、血压波动等情况，而副交感神经的调节功能减弱，使得心脏的神经调节失衡，引发心脏神经官能症的一系列症状，如患者可能会出现心跳加快、心慌，同时伴有呼吸不畅等表现。
环境因素
生活环境改变： 长期处于嘈杂、污染严重、生活节奏过快的环境中，会对人的神经系统产生持续的刺激。例如，在噪音过大的环境中生活或工作，会使人长期处于应激状态，影响神经功能的稳定，增加心脏神经官能症的发病几率。而且，长期处于不良的生活环境中，还可能导致睡眠质量下降，而睡眠不足又会进一步影响神经系统的调节功能，间接促使心脏神经官能症的发生。季节与气候影响： 季节变化和气候的剧烈改变也可能对心脏神经官能症有一定影响。比如在季节交替时，气温、气压等变化较大，部分人群可能会因为对环境变化的不适应，出现神经功能的波动，从而诱发心脏神经官能症的症状，像一些患者在秋冬季节可能更容易出现胸闷、心悸等不适症状。