宝宝半夜高烧39度，适宜的处理方式包括口服药物与物理降温。
一、口服药物：
1.当体温超过38.5°C时，需及时运用解热药物来治疗，常见的有对乙酰氨基酚、布洛芬等。需注意24小时内用药不可超过4次，且用法用量最好在医生指导下进行。
二、物理降温：
1.服用药物后若退热效果不佳可实施物理降温。宝宝发烧时常见的物理降温方法为使用温水擦浴，即用比宝宝体温低一到二度的温水擦拭颈部、腋窝、大腿弯曲处等血管丰富的部位。要注意不可使用白酒或酒精，以免引发不良反应。
2.父母还可在宝宝前额、颈部、腋窝和大腿处贴上退热贴，若宝宝对退热贴过敏，可让其多喝温开水，以增加体内水分的代谢。
如果上述这些方法的效果均不理想，建议立刻前往医院就诊，完善血常规等相关检测，并在医生指导下进行治疗。
总结概括提示：主要讲解了宝宝半夜高烧39度的处理办法，包括口服药物的种类、使用注意事项以及物理降温的具体方式和相关注意点，还强调了效果不好时应及时就医。