半夜发烧39度可采取物理治疗或药物治疗。
一、物理治疗：
1.温水擦拭身体：这是较为常用且效果较好的方法。通过用温水轻轻擦拭患者的颈部、腋窝、腹股沟等大血管丰富的部位，能帮助带走体表热量，促进散热。
2.冷敷：可以使用冰袋或冷毛巾敷在额头等部位，辅助降温。
3.多喝水：让患者多喝热水，有助于补充水分，同时也能促进身体散热，还要密切关注患者体温的变化情况。
二、药物治疗：
1.如果发烧严重且患者精神状态不佳，为防止病情延误或出现高热惊厥等危险情况，可在医生指导下合理使用药物。比如可以使用布洛芬，其具有解热镇痛的作用；对乙酰氨基酚也常用于退烧。
平时要注重身体保暖，保持室内良好的通风透气，减少细菌滋生的机会。同时，要多进行体育运动，这样能够增强身体的抵抗力。
总之，面对半夜发烧39度的情况，要根据具体情况合理选择治疗方法，日常也要做好防护和保健工作，以维护身体健康。