诊断黄体功能不全通常需要结合多种方法来综合判断。一般来说，通过基础体温测定、血清孕酮测定以及子宫内膜活检等方式来进行诊断。基础体温测定中，黄体功能不全患者的基础体温双向期小于11天；血清孕酮测定时，排卵后7天血清孕酮水平低于15ng/ml提示黄体功能不全；子宫内膜活检则可见分泌反应落后2天以上。
基础体温测定要点
测定方法： 每天清晨醒来后，在未进行任何活动前测量体温并记录。黄体功能不全患者的基础体温双向期通常会小于11天。注意事项： 要坚持每天测量，且保证测量环境和时间相对固定，这样才能保证基础体温测定结果的准确性。
血清孕酮测定情况
测定时间： 一般在排卵后7天左右进行血清孕酮测定。判断标准： 若排卵后7天血清孕酮水平低于15ng/ml，就提示可能存在黄体功能不全的情况。
子宫内膜活检内容
检查目的： 通过子宫内膜活检来了解子宫内膜的分泌情况。判断依据： 如果子宫内膜活检显示分泌反应落后2天以上，也有助于诊断黄体功能不全。
其他辅助检查
超声监测： 可以监测卵泡的发育及排卵情况，黄体功能不全时可能会出现卵泡发育不良、排卵后黄体形成不佳等情况。一般从月经周期的第8 - 10天开始监测卵泡，观察卵泡的大小、形态以及排卵时间等。激素六项检查： 黄体功能不全患者可能会出现雌激素、孕激素水平异常等情况。在月经周期的特定时期（如卵泡期、排卵期、黄体期）进行激素六项检查，若发现相关激素水平异常，也可辅助诊断黄体功能不全。