判断黄体功能不全可以从症状表现、血液检查以及子宫内膜活检等方面入手。一般来说，黄体功能不全的女性可能会出现月经周期缩短，比如原本28天左右的周期，可能缩短到21天左右，还可能在月经前出现少量阴道流血。
通过症状表现来初步判断
月经周期异常：黄体功能不全的女性，月经周期可能会明显缩短，比如正常月经周期是28 - 30天，而黄体功能不全者可能短至21天左右，而且这种缩短往往比较规律。经前异常出血：在月经来潮前1 - 2天，可能会出现少量的阴道流血现象，出血量一般较少，颜色可能为暗红色。
血液检查辅助判断
激素水平测定：在月经周期的第21天左右，检测孕激素水平。正常情况下，此时孕激素水平应该在15ng/ml以上，如果低于10ng/ml，就提示可能存在黄体功能不全。性激素六项检查：同时还可以检测雌二醇、卵泡刺激素、黄体生成素等指标。如果黄体生成素与卵泡刺激素的比例异常，也可能提示黄体功能不全相关问题。
子宫内膜活检来确诊
活检时间：在月经周期的第22 - 25天进行子宫内膜活检。活检结果判断：正常的子宫内膜在分泌期应该有良好的转化，比如腺体分泌旺盛、间质水肿等。如果子宫内膜活检显示分泌反应落后于正常天数2天以上，那就提示黄体功能不全。例如，月经周期第25天活检，内膜分泌反应却相当于月经周期第23天的水平，就说明黄体功能不足。