要判断黄体功能不全，可以从几个方面入手。首先，黄体功能不全可能会导致月经周期缩短，比如正常月经周期是28~30天，而黄体功能不全的女性可能月经周期会短于21天。另外，黄体功能不全的女性在受孕后容易出现流产，因为黄体分泌的孕激素不足，无法维持妊娠。
月经表现判断
月经周期缩短： 正常的月经周期一般是21~35天，黄体功能不全的女性，卵泡期可能正常，但黄体期会缩短，导致整个月经周期小于21天。比如原本月经周期是28天，突然变成20天，就要考虑黄体功能不全的可能。月经量异常： 部分黄体功能不全的女性月经量可能会有变化，比如月经量比以往减少，但这不是绝对的，需要结合其他表现综合判断。
基础体温监测
基础体温双相不典型： 女性每天清晨醒来后，在没有任何活动的情况下测量的体温就是基础体温。正常排卵后，黄体分泌孕激素，会使基础体温上升0.3~0.5℃，并持续12~14天，形成双相体温。如果基础体温双相，但高温期持续时间短于11天，或者高温相体温上升幅度不足0.3℃，那就提示可能存在黄体功能不全。
子宫内膜活检
黄体期子宫内膜活检结果异常： 在月经周期的第22~25天进行子宫内膜活检。正常情况下，黄体期子宫内膜应该有分泌期改变，比如腺体分泌旺盛、间质水肿等。如果子宫内膜活检显示分泌反应落后于正常2天以上，就提示黄体功能不全。例如，取到的子宫内膜组织的分泌程度比相应日期应有的分泌程度差，就符合这种情况。
激素水平测定
孕酮水平偏低： 在排卵后7天左右，正常女性的血清孕酮水平应该大于15ng/ml。如果这个时候孕酮水平低于15ng/ml，就提示黄体功能不全。比如检测发现孕酮值只有10ng/ml，那就要考虑黄体功能不全的可能。雌二醇水平异常： 黄体功能不全时，雌二醇水平也可能出现异常，比如排卵后雌二醇上升不明显等，但通常主要还是通过孕酮水平来辅助判断。