子宫腺肌症是子宫内膜腺体和间质侵入子宫肌层形成的弥漫或局限性的病变，目前其确切病因尚未完全明确，但有一些常见因素与之相关。据研究，约15%的子宫腺肌症患者合并子宫内膜异位症，约50%合并子宫肌瘤。
生育相关因素
多次妊娠与分娩： 经产妇患子宫腺肌症的几率相对较高，多次怀孕和分娩过程中，子宫肌层受到损伤，子宫内膜基底层细胞易侵入肌层，从而增加患病风险。比如有过3次及以上分娩经历的女性，患子宫腺肌症的可能性比未生育过的女性明显升高。人工流产手术： 频繁的人工流产会对子宫肌层造成损伤，也可能导致子宫内膜组织异位到子宫肌层中，进而引发子宫腺肌症。短时间内多次进行人工流产的女性，患病风险会增加。
雌激素相关因素
雌激素水平过高： 雌激素是刺激子宫内膜生长的重要激素，体内雌激素水平持续处于较高状态，会使子宫内膜过度增生并向肌层侵袭。例如长期服用含有雌激素的保健品，或者患有某些内分泌疾病导致雌激素分泌异常增多的女性，更容易患上子宫腺肌症。雌激素受体异常： 子宫肌层细胞上的雌激素受体如果出现异常，会使得子宫肌层对雌激素的敏感性增强，促使子宫内膜侵入肌层，引发子宫腺肌症。这种受体异常可能与遗传等因素有关。
遗传因素
家族遗传倾向： 有研究发现，子宫腺肌症具有一定的遗传易感性。如果家族中有亲属患有子宫腺肌症，那么其他女性成员患病的风险可能会高于普通人群。虽然具体的遗传方式还不十分清晰，但遗传因素在发病中起到了一定作用。基因变异影响： 某些特定基因的变异可能与子宫腺肌症的发生相关。比如一些涉及子宫肌层结构和子宫内膜代谢的基因发生变异时，会增加患子宫腺肌症的可能性，但目前对于具体是哪些基因变异以及如何影响发病的研究还在不断深入中。