指甲长在肉里面可依据具体病情采取消毒、抗感染、切开引流、拔甲等方式进行治疗，以缓解相关症状。
一、消毒：若只是存在轻微炎症，可考虑运用酒精、碘伏、醋酸铝溶液、氯己定溶液来冲洗患处。酒精能起到消毒杀菌的作用；碘伏具有广谱杀菌作用，可有效杀灭细菌、真菌等；醋酸铝溶液可以收敛、减少渗出；氯己定溶液对多种细菌有抑制作用。
二、抗感染：当局部炎症反应较为严重时，可在医生指导下使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等外用抗生素类药物。莫匹罗星软膏对常见的革兰阳性球菌有较好的抗菌活性；夫西地酸乳膏对一些引起皮肤感染的病菌有抑制效果。
三、手术：部分患者甲沟旁可能形成脓肿，这时就需要沿甲沟旁做纵行切口，将脓液引出。通过这种方式能及时排出脓液，减轻炎症和压力。
四、拔甲：如果感染反复出现，或许需要拔除患处的指甲。这是较为彻底的解决办法，但会对患者造成一定的痛苦和恢复期。
总之，针对指甲长在肉里的情况，要根据具体病情选择合适的治疗方法，以促进恢复，减少不适。