咳嗽时肚子两边疼可能由生理因素、支气管炎、胸膜炎等引起。以下是具体情况：
一、生理因素：
1.咳嗽时牵扯腹部肌肉，反射性引发肚子两边疼，这是咳嗽时常见现象。
2.可遵医嘱使用氢溴酸右美沙芬片、枸橼酸喷托维林片、阿莫西林胶囊等药物缓解咳嗽症状，随着咳嗽消失，腹痛也会随之消失。平时要多休息，避免过度劳累。
二、支气管炎：
1.咳嗽幅度大时对腹部肌肉形成明显牵拉。会出现咳嗽时肚子两边疼、嗓子肿胀等症状，还可能伴有全身无力、喉咙发痒等表现。
2.可遵医嘱服用盐酸氨溴索口服溶液、罗红霉素分散片、头孢克洛分散片等药物。日常注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物。
三、胸膜炎：
1.咳嗽时胸膜腔炎症使膈肌受累。会在咳嗽时出现肚子两边疼、低热、盗汗等症状，还可能伴有胸闷气短、胸壁疼痛、局部疼痛等情况。
2.可遵医嘱服用乙酰半胱氨酸泡腾片、头孢克洛分散片、阿司匹林肠溶片等药物。平时要鼓励病人积极排痰，保持呼吸道通畅。
总之，当出现咳嗽时肚子两边疼的情况，要根据具体病因进行针对性治疗和处理。同时，在日常生活中要注意休息和合理饮食，以促进身体恢复。