口腔溃疡诱发的病因较多，其中遗传因素约占40%-60%。比如有家族遗传史的人群，患口腔溃疡的概率相对更高。
局部创伤因素
口腔咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡，这种情况在日常生活中较为常见，尤其是进食速度过快的人群更容易出现。尖锐牙尖刺激： 牙齿的龋坏、残根残冠等形成的尖锐牙尖，会持续摩擦口腔黏膜，长期刺激下就可能诱发口腔溃疡，这类情况在口腔卫生较差、长期不看牙的人群中较多见。
免疫系统因素
自身免疫亢进： 当人体免疫系统出现异常，自身免疫反应过于活跃时，可能会错误地攻击口腔黏膜细胞，从而引发口腔溃疡。例如一些患有自身免疫性疾病的患者，像白塞病患者就常常会反复出现口腔溃疡症状。免疫功能低下： 当人体免疫功能低下时，比如长期熬夜、过度劳累、患有某些慢性疾病导致身体抵抗力下降等情况，口腔黏膜抵御外界病菌等侵害的能力减弱，就容易受到病菌感染而引发口腔溃疡，像长期熬夜的上班族就比较容易中招。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 尤其是维生素B族（如B2、B6等）和维生素C缺乏时，会影响口腔黏膜的正常代谢，导致口腔黏膜抵抗力下降，容易诱发口腔溃疡。有调查显示，饮食中蔬菜、水果摄入过少的人群，患口腔溃疡的几率比饮食均衡的人群要高。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡的发生有关。锌参与人体多种酶的合成和代谢，铁是血红蛋白的重要组成成分，缺乏这些微量元素会影响口腔黏膜的正常修复等功能，进而诱发口腔溃疡，比如素食者由于饮食中锌、铁等摄入相对较少，就可能更容易长口腔溃疡。