急性胃肠炎发热的处理需根据具体情况，包括发热严重程度等，主要方法有物理退烧、药物退烧，同时要针对急性胃肠炎本身进行治疗。
一、物理退烧：若急性胃肠炎发热程度不严重，体温未超过38.5℃，可选择物理退烧。可使用湿毛巾冷敷额头，也可利用20%的酒精擦拭腋窝和腹股沟等部位。物理退烧是通过热量的传导、对流和蒸发等方式来降低体温，这种方法较为温和，对身体的影响相对较小。
二、药物退烧：当急性胃肠炎发热较为严重，体温超过38.5℃时，可在医生指导下使用药物进行退烧，常用药物有布洛芬、对乙酰氨基酚、尼美舒利等。这些药物可以通过调节体温中枢来发挥退烧作用，但使用时需注意剂量和不良反应。
三、针对急性胃肠炎的治疗：除了退烧外，还需针对病因进行治疗。建议前往医院进行大便常规检查，若存在细菌感染，可在医生指导下使用抗生素类药物，如诺氟沙星、氧氟沙星等；若是病毒性的，可在医生指导下使用益生菌类药物改善，如双歧杆菌、枯草杆菌二联活菌等。若患者腹泻较重，还可使用肠黏膜保护剂和吸附剂进行治疗，比如蒙脱石散。
总之，对于急性胃肠炎发热，要综合考虑多种因素进行处理，既要缓解发热症状，又要针对病因进行有效治疗，以促进患者尽快康复。