新型冠状病毒肺炎主要通过病原学及血清学检查来确诊。一般来说，采集患者的鼻咽拭子、痰、下呼吸道分泌物等标本进行实时荧光RT - PCR检测新型冠状病毒核酸，若结果为阳性即可确诊。另外，采集血液标本进行血清学检测，如新型冠状病毒特异性IgM抗体和IgG抗体，若IgM抗体和IgG抗体由阴性转为阳性或恢复期IgG抗体滴度较急性期呈4倍及以上升高，也可辅助确诊。
核酸检测方面
标本采集要求： 采集标本时要规范操作，通常鼻咽拭子采集需轻柔准确，从鼻咽部采集合适长度的标本。痰标本采集则要求患者用力咳出呼吸道深部痰液。下呼吸道分泌物采集可能需要通过支气管肺泡灌洗等有创操作，但相对较少用。检测流程： 采集后的标本会被送往实验室，经过核酸提取等一系列步骤，利用实时荧光RT - PCR技术扩增检测病毒核酸。如果在扩增过程中检测到病毒特定的核酸序列，就判定为核酸检测阳性，支持新型冠状病毒肺炎的确诊。
血清学检测方面
抗体检测原理： 人体感染新型冠状病毒后，免疫系统会产生特异性抗体，包括IgM抗体和IgG抗体。IgM抗体一般在感染后早期出现，IgG抗体出现稍晚，但持续时间较长。检测意义： 进行血清学检测时，若患者急性期血清新型冠状病毒特异性IgM抗体阳性，提示近期感染；若恢复期血清新型冠状病毒特异性IgG抗体滴度较急性期呈4倍及以上升高，也可确诊为新型冠状病毒肺炎。不过，血清学检测需要动态观察抗体变化情况，单独一次检测阳性不能完全确诊，还需结合核酸检测等其他结果综合判断。
综合判断方面
结合临床表现： 新型冠状病毒肺炎患者通常有发热、干咳、乏力等临床表现，部分患者还可能出现鼻塞、流涕、咽痛、肌痛和腹泻等症状。在进行病原学和血清学检测的同时，医生会结合患者的临床表现来综合判断是否患有新型冠状病毒肺炎。例如，患者有符合新型冠状病毒肺炎的临床表现，同时核酸检测或血清学检测符合相应阳性标准，就更能明确诊断。排除其他疾病： 在确诊过程中，还需要排除其他类似病原体感染引起的疾病等。比如要排除流感病毒、副流感病毒、腺病毒等其他呼吸道病毒感染，以及肺炎支原体、衣原体等感染导致的肺炎，通过详细的病史询问、其他相关检查来进行鉴别诊断，以确保准确确诊新型冠状病毒肺炎。