男人阴茎短小的治疗方法需根据具体情况而定。一般来说，若成年男性阴茎勃起后长度不足3厘米，且影响性生活等，可能需要考虑手术治疗等方式，但手术有一定风险和适应人群。
非手术治疗情况
心理调节方面：
部分阴茎短小可能与心理因素有关，比如患者因过度担忧自身阴茎情况而产生焦虑等情绪。这时需要进行心理疏导，帮助患者正确认识自身情况，缓解焦虑情绪。心理调节需要长期坚持，可能需要几个月甚至更长时间来改善心理状态，但能在一定程度上减轻因阴茎短小带来的心理压力。
生活方式调整：
保持健康的生活方式对身体整体状况有影响。例如，要保证充足的睡眠，每天应保证7~8小时的高质量睡眠，睡眠不足可能会影响激素分泌等，而激素水平对生殖系统发育等有一定作用。同时，要适度运动，每周进行至少150分钟的中等强度有氧运动，如快走、慢跑等，运动有助于提高身体代谢和整体健康水平，但运动对阴茎短小本身的直接治疗作用有限，更多是从整体健康角度起到辅助作用。
手术治疗情况
手术方式选择：
目前常见的阴茎延长手术等有一定的适应人群。手术需要在正规医院由经验丰富的医生操作。手术有一定的风险，如出血、感染、阴茎勃起功能障碍等风险。一般来说，手术费用因地区、医院等因素有所不同，大致在几万元不等。
手术适应人群：
手术主要适用于成年男性，且阴茎短小是由于先天性发育异常等明确原因导致，并且经过充分评估后认为手术能带来收益大于风险的情况。例如，因先天性阴茎发育不良等情况，经过专业医生详细检查，包括激素水平检测、阴茎海绵体造影等检查后符合手术指征的患者。但并不是所有阴茎短小的男性都适合手术，比如存在严重心理疾病、凝血功能障碍等情况的患者就不适合手术。
激素治疗情况
激素检测与评估：
如果阴茎短小是由于激素缺乏引起，需要先进行激素检测，如性激素六项等检查。通过检测可以明确是否存在雄激素缺乏等情况。一般来说，检测费用在几百元不等。如果确诊是激素缺乏导致，可能需要考虑激素补充治疗，但激素补充治疗也有严格的适应证和禁忌证。例如，对于因下丘脑 - 垂体 - 性腺轴功能异常导致雄激素缺乏的患者，在排除禁忌证后可以考虑激素补充，但需要定期监测激素水平等指标，以确保治疗安全有效。不过，激素治疗对于阴茎短小的治疗效果也不是绝对的，而且存在一定的副作用风险，如可能增加患前列腺疾病等风险。