大便肛门疼可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。
2.外痔：肛缘皮肤皱襞突起，皮下有紫红色结节，排便或增加腹压时可增大，排便时可引起疼痛。
3.肛管炎：肛管部位发生急慢性炎症，也会引起疼痛，多伴有肛门下坠感。
4.肛窦炎：通常表现为肛门内间歇性疼痛，急性发作时肛门疼痛剧烈。
5.肛周脓肿：肛门周围出现红肿、疼痛的肿块，可能会破溃流脓。
6.直肠癌：肛管或直肠内的肿瘤破溃感染，也会引起肛门疼痛。
如果出现大便肛门疼的症状，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，在日常生活中要注意保持肛门清洁，饮食清淡，避免久坐久站，养成良好的排便习惯。