大便肛门疼的原因及治疗方法主要包括以下几个方面：
1.肛裂：
病因：肛裂是肛管皮肤全层纵行裂开所形成的小溃疡，常发生在肛门后、前正中，以肛门周期性疼痛、出血、便秘为主要特点。
病因导致症状的原理：肛裂的发生主要与肛管局部解剖结构、感染、外伤等因素有关。肛门内括约肌痉挛、肛管狭窄、粪便干结等可导致肛裂的形成。肛裂裂口上端的肛门瓣和肛乳头水肿，形成肥大乳头；下端皮肤因炎症、水肿及静脉、淋巴回流受阻，形成袋状皮垂向下突出于肛门外，形成肛裂痔。肛裂创面反复感染，纤维组织增生，形成赘皮性外痔（哨兵痔）。
治疗方法：急性或初发的肛裂可用坐浴和润便的方法治疗；慢性肛裂可用坐浴、润便加扩肛的方法；经久不愈、保守治疗无效且症状较重的肛裂可采用手术治疗。
2.外痔：
病因：外痔是齿线以下痔外静脉丛扩大曲张或破裂形成的柔软静脉团。
病因导致症状的原理：外痔位于齿线以下，是由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。
治疗方法：外痔的治疗方法主要有一般治疗、药物治疗和手术治疗。
3.肛周脓肿：
病因：肛周脓肿是指肛门周围软组织发生的急性化脓性感染，可形成脓肿。
病因导致症状的原理：感染是引起肛周脓肿的主要原因，常见的致病菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等。此外，肛裂、痔疮等肛肠疾病、免疫功能低下、糖尿病等也可诱发肛周脓肿。
治疗方法：肛周脓肿的治疗方法主要有手术治疗和非手术治疗。非手术治疗主要适用于早期脓肿、全身情况不能耐受手术者，常用的方法有抗生素治疗、温水坐浴、局部理疗等。手术治疗是治疗肛周脓肿的主要方法，可根据脓肿的位置和深浅选择不同的手术方式，如肛周脓肿切开引流术、肛周脓肿根治术等。
4.肛管或直肠肿瘤：
病因：肛管或直肠的良恶性肿瘤均可引起大便肛门疼。
病因导致症状的原理：肛管或直肠的肿瘤可导致肛管或直肠狭窄，粪便通过时可刺激肿瘤表面，引起疼痛。此外，肿瘤表面溃疡、感染等也可引起疼痛。
治疗方法：肛管或直肠肿瘤的治疗方法主要包括手术治疗、放疗、化疗、靶向治疗等。具体的治疗方法应根据肿瘤的类型、分期、患者的身体状况等因素综合考虑。
总之，大便肛门疼可能是多种疾病引起的，治疗方法也因病因而异。如果出现大便肛门疼的症状，应及时就医，明确病因，以便进行针对性的治疗。