一、睡眠因素导致
睡眠不足或睡眠质量差可引发早上起来眼睛通红。长时间熬夜、失眠等情况会使眼部血液循环不畅，眼部组织缺氧，毛细血管扩张，从而出现眼睛发红现象。例如，成人若连续熬夜后，眼部血管代偿性扩张就可能表现为晨起眼睛通红，儿童同样需保证充足睡眠，若睡眠不足也易出现此情况。
二、过敏因素引发
接触过敏原是常见原因。如枕巾、被褥上的尘螨，空气中的花粉、宠物毛发等，人体接触后引发过敏反应，免疫系统被激活释放组胺等物质，导致眼部结膜血管扩张、充血，出现眼睛通红，常伴有眼痒等症状，过敏体质人群更易受此影响。
三、感染因素所致
细菌或病毒感染眼部引发结膜炎等疾病时，会出现早上起来眼睛通红。细菌感染多表现为眼部分泌物增多，呈脓性；病毒感染常伴眼部异物感、流泪等，如病毒性结膜炎，病毒侵袭眼部组织引起炎症反应，导致结膜充血发红。
四、眼部刺激引起
睡前长时间使用电子设备，屏幕蓝光刺激眼部，或处于强光环境睡眠，强光持续刺激眼部，可导致眼部血管应激性扩张，晨起出现眼睛通红。另外，游泳时不注意眼部卫生，水中病原体侵入眼部也可能引发眼睛发红。