可在新生儿期进行筛查的疾病主要涵盖遗传代谢性疾病、听力功能障碍性疾病、视网膜病等。并且由于新生儿疾病筛查范围的持续扩大，先天性心脏病、新生儿免疫功能等方面的疾病也可进行筛查。
一、遗传代谢性疾病：
1.主要筛查的疾病包括苯丙酮尿症、先天性甲状腺功能低下等。同时，依据不同地域特点，部分地区还增添了筛查病种，像是先天性肾上腺皮质增生症、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症等。对这些遗传代谢性疾病在新生儿期实施筛查，有利于实现早诊断与早治疗。
二、听力功能障碍性疾病：
1.新生儿出生后48小时至出院前要完成初筛，未通过初筛者以及漏筛者需在42天内进行双耳复筛。
2.对于确诊为永久性听力障碍的新生儿，应在出生后6个月内展开相应的临床医学和听力学治疗。
三、视网膜病：
1.主要的筛查对象为胎龄小于34周或出生体重小于2公斤的所有早产儿，以及出生体重大于2公斤但病情危重且曾接受机械通气或CPAP辅助通气且吸氧时间较长的早产儿。
此外，根据具体情况，还可针对新生儿进行先天性心脏病、免疫功能障碍性疾病以及发育性髋关节发育不良等疾病的筛查。
总之，新生儿期的疾病筛查对于及时发现和治疗相关疾病具有重要意义，有助于保障新生儿的健康成长。