婴儿黄疸高主要有以下几方面原因。新生儿出生后，体内胆红素代谢会出现一些情况，约60%足月儿和80%早产儿在生后2 - 3天会出现生理性黄疸，这是因为新生儿肝脏处理胆红素的能力还不完善，导致血清胆红素水平升高，但一般情况良好，足月儿生后2周内、早产儿生后4周内黄疸会消退。
胆红素生成过多
红细胞增多症： 多见于有宫内窘迫、糖尿病母亲婴儿等情况，过多的红细胞被破坏，胆红素产生增加。比如一些因胎盘功能不全等导致胎儿血氧含量低的情况，会使红细胞数量增多，后续破坏后胆红素生成就会增多。同族免疫性溶血： 如ABO血型不合较为常见，母亲和胎儿血型不合，母亲体内抗体通过胎盘进入胎儿体内，引起胎儿红细胞破坏，从而使胆红素生成增加。例如母亲是O型血，胎儿是A型或B型血时，就可能发生ABO血型不合溶血，导致黄疸高。
肝脏胆红素代谢障碍
肝细胞摄取胆红素能力低下： 一些早产儿可能存在肝细胞内Y、Z蛋白含量不足的情况，影响胆红素的摄取。Y、Z蛋白是肝细胞内摄取胆红素的重要载体，早产儿出生时这些蛋白含量相对较低，就会使胆红素摄取减少，导致黄疸高。肝脏结合胆红素功能差： 肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶（UGT）含量低且活性不足，会影响胆红素与葡萄糖醛酸结合形成结合胆红素。早产儿肝脏中UGT活性更低，足月儿生后酶活性也逐渐增加，一般要到出生后1周左右才能达到正常水平，所以早产儿更容易出现因肝脏结合胆红素功能差导致的黄疸高。
胆汁排泄障碍
新生儿肝炎： 多由病毒感染引起，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等，病毒感染肝脏后，肝细胞受损，影响胆红素的代谢和排泄，导致胆红素在体内积聚，引起黄疸。例如巨细胞病毒感染，可造成肝细胞炎症，阻碍胆汁排泄途径。胆道闭锁： 是一种肝内外胆管闭锁，使胆汁排泄障碍，胆红素堆积。这是新生儿期阻塞性黄疸的常见原因，多在出生后2周左右黄疸逐渐明显，并且进行性加重，若不及时治疗，会导致肝硬化等严重后果。