婴儿黄疸高主要与胆红素代谢特点等因素有关。新生儿出生后，胆红素产生相对过多，而肝脏对胆红素的摄取、结合和排泄功能尚未成熟，这是导致大部分新生儿出现生理性黄疸的常见原因，一般足月儿生理性黄疸在出生后2-3天出现，4-5天达到高峰，7-10天消退。
胆红素生成过多
红细胞破坏过多： 婴儿出生时可能存在红细胞增多症，比如有脐带结扎延迟等情况，会使红细胞数量较多，后续破坏就会产生较多胆红素。还有母婴血型不合，像ABO血型不合或Rh血型不合，母亲的抗体进入婴儿体内，破坏婴儿红细胞，从而使胆红素生成增加。血红素加氧酶含量高： 新生儿体内血红素加氧酶含量比成人高，这种酶会促进血红素分解为胆红素，导致胆红素生成相对较多。
肝脏胆红素代谢障碍
摄取胆红素能力不足： 新生儿肝脏内Y、Z蛋白含量低，在出生后1周左右才达到成人水平，所以摄取胆红素的能力有限，容易导致胆红素在体内堆积。结合胆红素功能差： 肝脏中尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UDPGT）活性不足，约为成人的1%，要到出生后1周左右才逐渐增加，这就使得胆红素与葡萄糖醛酸结合形成结合胆红素的能力较弱，影响胆红素的代谢。
胆汁排泄障碍
胆道阻塞： 婴儿可能存在先天性胆道闭锁，这会阻碍胆汁排出，使得结合胆红素不能顺利排入肠道，进而反流入血液，导致黄疸升高。新生儿肝炎： 感染等因素可能引发新生儿肝炎，使得肝细胞功能受损，胆汁排泄受到影响，胆红素排泄不畅，从而导致黄疸持续或加重。