脑萎缩的原因较多，其中衰老因素较为常见，随着年龄增长，约65岁以上的老年人中，有超过10%的人会出现不同程度的脑萎缩。
一、衰老相关因素
自然衰老过程： 随着年龄不断增长，人体的脑组织会逐渐发生萎缩，这是一种生理性的变化。就像机体其他器官会有一定程度的退变一样，大脑也不例外，细胞会逐渐老化，脑实质会慢慢减少，从而导致脑萎缩。慢性疾病影响： 一些慢性疾病如果长期没有得到良好控制，也会加速脑萎缩进程。例如高血压，长期高血压会使脑血管受到损伤，影响脑部的血液供应，久而久之就可能引发脑萎缩。据统计，有高血压病史且血压控制不佳的人群，脑萎缩的发生风险比血压正常人群要高。
二、疾病因素
神经系统疾病： 像阿尔茨海默病，这是一种常见的导致脑萎缩的神经系统退行性疾病。患者大脑中的神经元会逐渐退化死亡，大脑皮质会萎缩，尤其是海马体等与记忆相关的区域萎缩较为明显。还有帕金森病，也会引起脑萎缩，主要是中脑黑质等部位的神经细胞变性死亡，进而导致脑结构改变出现萎缩。脑部创伤： 严重的脑部创伤，比如车祸导致的重度颅脑损伤，或者是高处坠落等造成的脑部撞击伤。脑部受到外伤后，脑组织会受到不同程度的损害，可能会引起局部脑组织坏死、出血等，后续修复过程中可能会出现脑萎缩。如果是儿童时期发生严重脑部创伤，对脑发育的影响更大，更容易出现脑萎缩相关问题。脑血管疾病： 脑梗死就是常见的脑血管疾病之一。当脑部血管发生堵塞，相应供血区域的脑组织会因为缺血缺氧而坏死，之后坏死的脑组织被吸收，就会导致脑萎缩。脑出血患者，血液积聚在脑内会压迫周围脑组织，引起脑组织损伤，也可能引发脑萎缩。有过脑梗死或脑出血病史的人群，脑萎缩的发生几率明显高于没有此类病史的人群。
三、其他因素
遗传因素： 某些遗传性疾病会导致脑萎缩。比如遗传性共济失调，这是一组以共济失调为主要临床表现的神经系统遗传变性病，患者会出现进行性的脑萎缩，主要是小脑等部位的萎缩，病情会逐渐进展，影响患者的运动、平衡等功能。如果家族中有此类遗传性疾病的患者，后代患病风险会增加。不良生活方式： 长期大量饮酒也可能导致脑萎缩。酒精会对大脑神经细胞产生毒性作用，破坏神经细胞的正常功能，还会影响脑部的血液供应和营养物质的输送，长期下去就会引起脑萎缩。有长期酗酒史的人，比正常人群患脑萎缩的可能性要高很多。另外，长期营养不良，身体缺乏一些重要的营养物质，如维生素B1等，也可能影响脑部的正常代谢，增加脑萎缩发生的风险。