事后紧急避孕药主要通过影响女性的排卵、受精或着床过程来达到避孕目的。一般在无保护性生活或避孕失败后72小时内服用有效。
影响排卵
抑制排卵： 紧急避孕药中的成分可以抑制卵巢正常的排卵功能。正常情况下，女性每个月经周期会有一个卵泡发育成熟并排卵，而紧急避孕药能干扰这个过程，使卵巢暂时不排出卵子，从而减少受孕的机会。例如，左炔诺孕酮类紧急避孕药就有这样的作用机制，它可以作用于下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴，抑制卵泡的发育和排卵。
干扰受精过程
改变宫颈黏液性状： 紧急避孕药会使宫颈黏液变得黏稠，这样精子就难以穿过宫颈进入子宫腔。正常的宫颈黏液在排卵期是稀薄、透明且利于精子通过的状态，而服用紧急避孕药后，宫颈黏液变得像糊状一样，阻碍精子的通行，降低精子与卵子相遇结合的概率。比如，服用毓婷（左炔诺孕酮片）后，宫颈黏液性状会发生改变，不利于精子穿透。影响输卵管蠕动： 它还可能影响输卵管的正常蠕动，使得受精卵难以顺利通过输卵管到达子宫腔。输卵管的蠕动是将受精卵向子宫方向输送的重要动力，紧急避孕药干扰了这种蠕动，让受精卵在输卵管内停留或运行受阻，进而无法正常着床。
阻止着床
抑制子宫内膜发育： 紧急避孕药会影响子宫内膜的正常发育，使其不利于受精卵着床。子宫内膜需要在合适的时机增厚、转化，以接纳受精卵着床。而紧急避孕药会干扰子宫内膜的这种变化，让子宫内膜的状态不适合受精卵种植，即使精子和卵子结合形成了受精卵，也无法在子宫腔内成功着床。例如，它可能使子宫内膜变薄或者分泌反应不良，从而阻止受精卵着床成功。