口舌生疮的原因有多种。一般来说，机体缺乏维生素B₂等营养素时容易引发口舌生疮，比如有研究显示，约30%的口舌生疮患者存在维生素B₂摄入不足的情况。
一、营养缺乏因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B₂、维生素B₁₂等时，就容易出现口舌生疮。例如长期挑食、节食的人，很可能会因为维生素摄入不均衡而引发口舌生疮。微量元素缺乏： 像锌元素缺乏也可能导致口舌生疮。人体缺锌时，会影响细胞的正常代谢，从而增加口舌生疮的发生几率。
二、口腔局部刺激因素
创伤性因素： 牙齿咬伤、佩戴不合适的假牙等都可能造成口腔黏膜损伤，进而引发口舌生疮。比如不小心咬到舌头或口腔内壁，伤口如果没有及时愈合，就容易发展成口疮。口腔卫生不良： 不注意口腔清洁，食物残渣容易在口腔内滋生细菌，刺激口腔黏膜，增加口舌生疮的发生风险。例如长时间不刷牙、不漱口，口腔内细菌大量繁殖，就可能引发口舌问题。
三、全身疾病因素
消化系统疾病： 患有胃溃疡、十二指肠溃疡、结肠炎等消化系统疾病时，可能会影响营养物质的吸收，从而诱发口舌生疮。比如患有胃溃疡的患者，由于消化功能受到影响，身体对营养的摄取和利用出现障碍，就比较容易出现口舌生疮的情况。免疫系统疾病： 像白塞病等免疫系统疾病，会导致口腔黏膜反复出现溃疡，也就是口舌生疮的情况。这类患者的免疫系统出现异常，会攻击自身的口腔黏膜组织，引发反复的溃疡症状。