胃食管反流病的发生与多种因素有关。一般来说，食管下括约肌功能障碍是重要原因之一，比如约有1/3的胃食管反流病患者存在食管下括约肌压力降低的情况。
食管下括约肌相关因素
食管下括约肌结构异常： 食管下括约肌由食管末端的环形肌组成，若其结构出现问题，比如肌肉本身发育不良等，就会导致括约肌功能减退，使得胃内容物容易反流至食管。食管下括约肌功能障碍： 除了结构问题，一些生理因素也会影响食管下括约肌功能，像进食过多、肥胖等情况，都可能使食管下括约肌压力降低，从而引发胃食管反流。例如，体重指数超过正常范围（BMI≥24）的人群，发生胃食管反流病的风险相对更高。
食管清除作用异常
食管蠕动异常： 正常情况下，食管蠕动可以将反流的胃内容物有效清除。但当食管蠕动出现异常时，比如蠕动减弱，就会影响对反流物的清除能力，导致反流物在食管内停留时间延长，刺激食管黏膜，引发胃食管反流病。唾液分泌减少： 唾液可以中和胃酸、清除反流物，对食管有保护作用。如果唾液分泌减少，比如一些老年人因疾病等原因导致唾液分泌不足，就会使食管的自我清除能力下降，增加胃食管反流病的发生几率。
胃排空延迟因素
胃排空障碍： 胃排空速度减慢时，胃内食物潴留，胃内压力升高，更容易导致胃内容物反流至食管。例如，糖尿病患者由于自主神经病变等原因，常常会出现胃排空延迟的情况，进而增加患胃食管反流病的可能性。其他因素影响胃排空： 一些药物也可能影响胃排空，比如抗胆碱能药物等，服用这类药物后可能会导致胃排空延迟，从而诱发胃食管反流病。