胃食管反流病的发生主要与多种因素有关。一般来说，下食管括约肌功能障碍是重要原因之一，比如约有1/3的胃食管反流病患者存在下食管括约肌压力降低的情况。
食管下括约肌功能异常
食管下括约肌结构异常： 食管下括约肌由食管末端的环形肌组成，若其结构出现问题，比如肌细胞数量减少等，就会影响其正常功能，导致抗反流屏障减弱。食管下括约肌压力降低： 正常情况下食管下括约肌能维持一定压力防止胃内容物反流，当压力低于正常水平时，就容易发生胃食管反流，有研究显示约30% - 50%的胃食管反流病患者存在食管下括约肌压力降低的情况。
食管清除作用降低
食管蠕动异常： 食管蠕动可以将反流物及时清除，若食管蠕动功能出现障碍，比如蠕动减弱，就会使反流物在食管内停留时间延长，增加对食管黏膜的刺激时间。唾液分泌减少： 唾液可以中和胃酸、清除反流物等，当唾液分泌减少时，对食管的保护作用减弱，也容易引发胃食管反流病，老年人由于唾液腺功能减退等原因，唾液分泌相对较少，患胃食管反流病的风险可能相对较高。
胃排空延迟
胃排空障碍： 胃排空速度减慢会使胃内压力升高，当胃内压力超过食管下括约肌压力时，就容易导致胃内容物反流至食管。例如，一些糖尿病患者可能会合并胃排空延迟的情况，从而增加胃食管反流病的发生风险。饮食习惯影响： 暴饮暴食、进食过多高脂肪食物等不良饮食习惯也会影响胃排空，进而诱发胃食管反流病，长期大量进食高脂肪食物会延缓胃排空，使胃内压力增高，容易引发反流。