半夜肚子疼醒可能由腹部着凉、急性胃肠炎、消化性溃疡等原因所致，建议及时就诊，并依据具体原因采取针对性治疗。
一、腹部着凉：夜间睡眠时若未做好腹部保暖，致使寒气侵袭，就会引发腹部平滑肌收缩痉挛，进而导致疼痛。此时可采用热水袋进行局部热敷，适当按揉也有助于缓解疼痛。
二、急性胃肠炎：如果进食了不卫生或霉变的食物，会使胃肠道出现急性炎症，从而导致半夜肚子疼醒，通常还伴有大便次数增多，可能会排水样大便。可使用洛派丁胺、黄连素片、蒙脱石散等药物进行治疗。
三、消化性溃疡：包含胃溃疡和十二指肠溃疡。由于半夜时没有食物来中和胃酸，胃酸对溃疡面产生刺激便会引起肚子疼，往往还伴有反酸、烧心、嗳气等症状。可给予奥美拉唑、泮托拉唑、硫糖铝等药物进行医治。
总之，半夜肚子疼醒的原因多样，需要明确具体病因后进行妥善处理和治疗。