急性肠胃炎可以使用一些药物来缓解症状，一般来说，常用的药物有蒙脱石散、黄连素等。通常情况下，及时用药能在一定程度上较快改善腹泻、腹痛等不适。
止泻药物选择
蒙脱石散：这是常用的止泻药，它可以在肠道内形成一层保护膜，吸附病原体和毒素，起到止泻作用。成人及儿童都可使用，但儿童使用时要注意按剂量服用。药用炭：能吸附肠道内的气体和毒素，对腹泻有一定的缓解作用，可用于急性肠胃炎引起的轻度腹泻情况。
缓解腹痛的药物
颠茄片：能解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解腹痛症状。不过，前列腺肥大患者、青光眼患者等要慎用，因为颠茄片可能会加重这些患者的病情。山莨菪碱：也可用于缓解胃肠道痉挛引起的疼痛，它能改善胃肠道微循环，但脑出血急性期及青光眼患者禁用。
调节肠道菌群的药物
双歧杆菌四联活菌片：可以补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，有助于改善急性肠胃炎导致的肠道菌群失调情况。一般来说，冷藏保存能更好地保持药物活性。枯草杆菌二联活菌颗粒：同样能调节肠道菌群，对急性肠胃炎引起的腹泻、腹胀等症状有一定的改善作用，适用于儿童等人群，但服用时要注意用温水冲服，水温不宜过高。
抗感染药物使用情况
如果是细菌感染引起的急性肠胃炎，可能会用到抗感染药物。比如诺氟沙星，它对肠道常见的一些细菌有抑制作用，但18岁以下的青少年禁止使用诺氟沙星，因为可能会影响骨骼发育。而对于病毒感染引起的急性肠胃炎，一般不需要使用抗感染药物，主要是进行对症支持治疗。