治口腔溃疡并没有绝对最好的药，常用的有局部用药和全身用药等。一般来说，局部用药能较快缓解症状，比如含漱剂，像0.02%氯己定含漱液，大概每天含漱3 - 4次，能起到抗菌消炎的作用；还有含片，西地碘含片，一次1片，一天3 - 5次，可杀菌抗感染。
局部外用药物
含漱剂类：除了0.02%氯己定含漱液，还有依沙吖啶溶液也可用于口腔溃疡，用它含漱能清洁创面，促进愈合，一般每天含漱3 - 4次。散剂类：冰硼散是比较常用的，直接撒在溃疡面上，能起到清热解毒、消肿止痛的作用，但儿童使用要谨慎，避免误吞。
局部涂抹药物
凝胶类：重组人表皮生长因子凝胶就很不错，它能促进细胞生长和修复，直接涂在溃疡处，一天涂抹数次，能加快溃疡愈合。糊剂类：珠黄散糊剂也是常用的，将其涂抹在溃疡部位，有去腐生肌的效果，有助于口腔溃疡好转。
全身用药情况
维生素类：如果是因缺乏维生素引起的口腔溃疡，可以补充维生素B族，比如维生素B2，一般来说，成人每天补充量在5 - 10毫克，但要在医生指导下使用，儿童用量会有所不同。免疫调节剂：对于反复发作者，可能会用到免疫调节剂，如转移因子胶囊，它能调节免疫功能，但孕妇和儿童使用需咨询医生，根据具体情况判断是否适用。不过，每个人的口腔溃疡情况不同，用药也会有差异。如果口腔溃疡长时间不愈合或者反复发作，一定要及时就医，由医生根据具体情况来选择合适的治疗方案，而不是自行随意用药。同时，在使用药物过程中，要注意观察自身反应，如有不适要及时停药并就诊。