头皮上的毛囊炎可以使用抗生素类药物等治疗，一般轻中度头皮毛囊炎可以先尝试外用药物。比如外用莫匹罗星软膏，它对革兰阳性球菌有很好的抗菌作用，能抑制细菌的蛋白质合成，从而起到杀菌消炎的效果，一般药店都能买到，价格相对较为亲民，大概几元到十几元一支。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏： 主要针对革兰阳性球菌引起的头皮毛囊炎，能有效抑制细菌生长。使用时清洁头皮后，薄薄涂抹一层在患处，一天可以用2 - 3次。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的金黄色葡萄球菌等有较好的抗菌活性。用法也是清洁头皮后，取适量乳膏涂抹在患处，每天使用2 - 3次。
抗真菌类药物
酮康唑洗剂： 如果头皮毛囊炎是由真菌感染引起的，像马拉色菌感染导致的，酮康唑洗剂就很适用。它可以抑制真菌细胞膜的合成，发挥抗真菌作用。使用时先将头发湿润，取适量洗剂涂抹在头皮上，轻轻按摩3 - 5分钟后冲洗干净，一般一周使用2次左右。二硫化硒洗剂： 也可用于治疗真菌或马拉色菌引起的头皮毛囊炎。使用方法是先将头发用温水浸湿，取适量洗剂涂抹按摩头皮，3 - 5分钟后冲洗，每周使用1 - 2次。
注意事项
头皮清洁： 要保持头皮清洁卫生，建议每天用温和的洗发水洗头，但注意不要过度清洁，以免破坏头皮的正常屏障功能。一般正常头皮每天洗头1次即可，如果头皮油脂分泌较多，可适当增加洗头次数，但不要超过2次。生活习惯： 生活中要注意规律作息，保证充足睡眠，一般成年人每天需要7 - 8小时的睡眠时间，这样有助于提高身体免疫力，利于毛囊炎的恢复。同时要避免吃辛辣、油腻等刺激性食物，比如辣椒、油炸食品等，这些食物可能会加重头皮油脂分泌，不利于毛囊炎康复。如果是儿童患有头皮毛囊炎，家长要特别注意孩子的个人卫生，督促孩子不要用手搔抓头皮，防止感染扩散。