卵圆孔未闭和房间隔缺损都是心脏方面的问题，但有明显区别。卵圆孔未闭在正常人群中发生率较高，约20% - 25%的成年人存在卵圆孔未闭。而房间隔缺损是先天性心脏病的一种，发病率相对卵圆孔未闭低些。
解剖结构差异：
卵圆孔未闭： 卵圆孔是胎儿时期心脏房间隔上的一个生理性通道，一般在出生后1年左右闭合。若超过3岁仍未闭合则称为卵圆孔未闭，它是房间隔组织上的一个小裂隙样未闭结构。房间隔缺损： 是指原始房间隔在发生、吸收和融合过程中出现异常，导致左右心房之间残留未闭的缺损。缺损大小不一，小的可能几毫米，大的可达到数厘米。
临床表现不同：
卵圆孔未闭： 多数卵圆孔未闭的人没有明显症状，往往是在体检做心脏超声时偶然发现。部分人可能会有偏头痛，尤其是与卵圆孔未闭相关的偏头痛患者，可能在潜水、高空飞行等情况下，因右向左分流导致脑栓塞等情况，但这种情况相对较少见。房间隔缺损： 缺损小的房间隔缺损儿童可能无症状，仅在体检时发现心脏杂音。缺损较大时，儿童可能会出现生长发育迟缓、反复呼吸道感染、活动后气促等表现；成年人可能会有乏力、心悸、活动耐力下降等症状，随着病情进展还可能出现右心衰竭等表现。
诊断方法有别：
卵圆孔未闭： 主要依靠心脏超声检查来诊断，通过超声心动图可以观察到房间隔上卵圆孔处的分流情况。经胸超声心动图有时可能难以清晰显示，这时可以采用经食管超声心动图等更精准的检查方法。房间隔缺损： 心脏超声是诊断房间隔缺损的主要手段，除了观察缺损部位和大小外，还能评估心脏结构和功能的改变。另外，心电图、胸部X线等检查也有助于辅助诊断，胸部X线可能会显示心脏扩大等情况。
治疗方式有差异：
卵圆孔未闭： 对于无症状且未发生相关并发症的卵圆孔未闭，一般不需要特殊治疗，定期随访心脏超声观察即可。但对于有明确与卵圆孔未闭相关的偏头痛频繁发作，或者有发生脑栓塞风险的患者，可能会考虑介入封堵治疗。房间隔缺损： 小型房间隔缺损如果无症状，有可能在儿童期自行闭合，可以定期随访。而较大的房间隔缺损或者有症状的房间隔缺损通常需要治疗，治疗方法包括介入封堵治疗和外科手术修补等，通过关闭缺损来恢复心脏正常的结构和功能。